A resolução de um
scanner é medida pela quantidade de pontos por polegada que ele é capaz de reconhecer. Um scanner com resolução de 400 DPI é capaz de gerar imagens com 400 pontos por polegada.
Há dois tipos de resolução: a resolução ótica, aquela que é utilizada pelo leitor ótico do scanner ao digitalizar a imagem e a resolução máxima, que é conseguida através de software. Por exemplo, o scanner HP Scanjet 5p possui uma resolução ótica de 300 DPI (ou seja, esta é a sua verdadeira resolução) e uma resolução máxima de 1200 DPI. Esta última é uma resolução conseguida somente através do driver TWAIN do scanner, através de uma técnica de interpolação.
Comparação da resolução dos principais scanners de mesa do mercado.

Em geral, quanto maior a resolução do scanner, melhor. Porém isto depende de aplicação. Em aplicações de uso caseiro, qualquer scanner é bom, por um motivo bem simples: você não conseguirá imprimir imagens com resoluções muito altas. A maioria das impressoras jato de tinta do mercado possuem resolução de 300 DPI e as melhores impressoras caseiras chegam a até 720 DPI. Ou seja, não adianta nada capturar uma super imagem de 9600 DPI para imprimir em uma impressora comum - haverá perda de qualidade.
No caso de aplicações profissionais, como editoração eletrônica, o papo é outro. Em geral os profissionais têm acesso a impressoras de melhor qualidade, geralmente em birôs de impressão. Neste caso, o céu é o limite.
Hoje todos os scanners reconhecem cores, basicamente em duas resoluções: 24 bits, onde o scanner é capaz de reconhecer pouco mais de 16 milhões de cores e 30 bits, onde o scanner reconhece pouco mais de 1 bilhão de cores. Os scanners de 30 bits possuem uma fidelidade muito maior no reconhecimento das cores da imagem que está sendo transferida para o micro.