Se essa ideia fosse tão tosca, o Silent PC Review não teria publicado (há 5 anos e meio).
http://www.silentpcreview.com/article6-page1.html
Particularmente, acho esse truque muito válido. Vejam o meu caso:
Tenho 3 ventoinhas no meu gabinete, e a mobo só controla duas (no meu caso, a do processador e de exaustão).
A ventoinha frontal, que insufla ar para dentro do gabinete e refrigera os HD's, não tem controle, por isso a deixo sempre ligada em 5 volts.
Será que é tão absurdo assim? Será que vale a pena pagar 50 reais em um bay bus pra deixar uma ventoinha sempre no mínimo?
Citando o artigo do SPCR:
"As soon as you begin trying to quiet your PC, you realize how useful it is to be able to provide lower than 12 volts DC (VDC) to fans in the system. Most PCs don't provide any way to control the speed of the fans. There may be accessories you can buy, but sometimes, things like fan bays are overkill."
Sem mais.