Dicas, Dúvidas e Problemas - Folding@Home

Tópico destinado à discussão e solução de problemas encontrados com o uso do Folding@home, assim como as dúvidas relacionadas ao uso do programa.

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O tópico inicial sobre o projeto foi desmembrado e as mensagens que não se enquadravam em outros tópicos direcionadas para este.

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SOMENTE FOLDING@HOME !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

Olha a Guanina, Citosina, Timina, Adenina, só lembrando

DNA-> RNA

RNA mensageiro, ribossomos, RNA ribossomico.

Eita coisa boa.

Parabéns XITA.

Olha o Flood in home aí kkkkkkkkk

Acho que vou começar a estudar essas proteinas de novo...

Eu não extendi esse ponto pra não sair do foco do assunto, se fosse explicar bem detalhadamente a síntese de proteínas iria demorar pra fazer..

Opa, ideia de primeira, Xita e o pessoal que estão colaborando tão tudo de parabéns.

Cabei de baixa o programa e ta rodando aqui, vamos ajudar no que a gente pode galera, um programinha rodando em segundo plano num mata ninguem e qualquer um pode ajudar.

Parabéns pela ideia, abrasssss

Valeu pela participação, espero que esteja rodando sem problemas no seu PC.

Vamos ver em breve os resultados do time.

A ideia não foi bem minha, eu só decidi testar isso em algumas máquinas e depois trouxe pra cá, pois acho que é proveitoso para o forum.

XITA.

Agora tenho 2x perguntas.

Quanto esstiver usando o programa o processador vai dar 100% ?

E quanto ao limite do trafego feito por alguns provedores ?

Abraço.

Sim vai, mas só se seu processador estiver ocioso, se você for abrir algum outro programa o folding diminui a carga de processamento e passa a bola para o outro programa.

O limite de dados não conta muito pois os arquivos são pequenos, até 10 MB, ou menores que 5 em alguns casos, e eles demoram alguns dias para serem executados.

Foi curioso, eu acabei agora mesmo de colocar essas duas perguntas e respostas no post de perguntas, pois o Mindu me perguntou por MP e eu tinha esquecido de colocar.

Muito legal isso.

Baixei o meu cliente e já to foldando

Pena que minha máquina não seja tão poderosa assim, mas tá valendo.

Mas eu tenho uma dúvida, quando aponta pro ícone do F@H no SystemTray, aparece assim

"CPU - F@H: Working (0/5000)"

E agora pouco passou pra 50/5000

O que seria esse progresso?

Opa, valeu por participar

Sua máquia é igual à minha, e eu precisei de 6 PCs pra me baterem (3 P4, 3 K7) no meu time, não acho nosso 3200 fraco

Putz esqueci de falar isso.

Esse processo é que você concluiu 50 passos de 5000, 1%, se olhar seu arquivo de log vai aparecer qual a porcentagem já concluída.

Mas, isso varia de uma WU pra outra.. ja vi 125, 250, 500, 5000.. e cada uma roda em uma velocidade.. tem umas de 125 que são "duras", outras de 125 que rodam em duas horas, não dá pra prever nada hehehehe

Ah, só um pedido, quem estiver participando, por favor, coloque na assinatura que está participando.

Obrigado !

Aêêee!

Demorou hein?!

Parabéns XITA, assim que estiver com meu PC de volta, vou dar a minha humilde contribuição com meu micro se possível em 24/7. De todo jeito ele fica assim quase que direto, pelo menos vai ter mais uma utilidade além de downloads.

abraços.

Estranho essa questão de pacotes... ja to no meu terceiro pacote e até agora só veio pacote de 150, isso é normal????

Tem alguma opção que eu possa mexer pra vir pacotes maiores pois o meu PC fica ligaro direto e pra mim num tem problema nenhum deixar o meninão rodando hehe.

Abrasssssssss.

Sim é, a seleção ocorre aleatóriamente, meu primeirom pacote levou quase uma semana pra acabar, o quarto foi em 4 horas.. isso é variável.

Como você possui um processador Intel pode selecionar a opção "allow receptiom of big WUs" na aba "Conection", aí seu PC vai baixar uns grandões.

Ah, podem vir outros grandes sem que você selecione esta opção.

Bom estou participando e de quebra peguei um GROMACs core de 10000 passos!

estou quase terminando, só tenho dúvidas que meu cliente é VGA e meu processador que tá sendo puxado, ao analisar a placa de vídeo pelo GPU-Z, a velocidade de clock dela buga totalmente, quando o F@H está em execução, porém não vejo problemas nisto...

acho que na parte de configuração avançada, onde você decide quanto % o programa vai usar do CPU, deveria ser GPU em clientes GPU, sendo assim causando confusão para os usuários, como eu fiquei confuso até perceber que ao olhar para a tela de processos, onde as bolinhas vibram, a placa de vídeo faz um ruído de processo, pelo menos a minha faz, o que fez que eu percebesse que realmente é a placa de vídeo que está operando o programa, no entanto o uso da CPU deve ser somente da troca de informações da VGA com o processador!

Poer exemplo: eu uso minha HD4870, quando eu marco 100% de uso de CPU, os processos de vibração das moléculas lá na tela de dysplay do programa, vibram sem parar!

quando reduzo o uso de CPU para 30%, elas vibram de pouco em pouco, e o ruído de processamento da minha VGA segue em saltos como expliquei acima, quando ela processa as moléculas mechem e ai para, as a VGA processa e as moléculas mechem, fazendo com que os passos contém obviamente!

Então se algum cliente tray de VGAs tinha essa dúvida, deixe de ter!

Interessante, valeu por compartilhar !

Pode ser que, se deixar sua GPU em 30% ela opere em clock mais baixo ou se estresse menos, por isso também esquenta menos.

O movimento das bolinhas é a dinâmica acontecendo

Não tive a oportunidade de ver um cliente GPU em operação, mas já vi dinâmicas moleculares em outros programas e a coisa é linda auhauuaauha

É interessante visualizar como as coisas que sabemos em teoria ocorrem "na prática".

Xita, primeiro de tudo, parabéns pela iniciativa. E nós dois sabemos a falta que faz infelizemnte o core gpu gromacs desse troço não ser aberto, pra gente usar nos NOSSOS trabalhos!

Valeu Johanners !

Não vejo tanta falta assim (eu ainda não to usando o GROMACS iuahauhauhauha), mas eles estão trabalhando juntos e sei que isso vai aos poucos render frutos para o aprimoramento do GROMACS. Isso vai ser muito dahora !

Mas vamos lá: o texto tá excelente, e só te sugeriria pra melhorar em alguns pontinhos:

1 - lá na parte onde tu explica a diferença entre estrutura primária de uma proteína e o q o folding é exatamente, eu iria mais fundo, e explicaria (curto, meia linha no máximo) as benditas estruturas secundárias, terciárias e quaternárias da parada... porque aí sim, a dimensão do abacaxi fica visível.

Eu tinha pensado nisso, mas tem como explicar as estruturas secundárias e terciárias num curto espaço ?

Imagem não é o problema. Bom que cheguei nisso agora nos meus estudos

2 - O texto sobre dinâmica eu colocaria só com mais as coisinhas em negrito: "A Dinâmica Molecular consiste em uma simulação do comportamento de várias moléculas ao longo de um determinado espaço de tempo. Tipicamente, apesar de sistemas químicos serem regidos pela Física Quântica, a dificuldade de cálculo associado leva a aproximar o comportamento das mesmas para o esperado pela Mecânica Clássica ou Newtoniana (de forma mais clara: baseando-se na mecânica clássica, a dificuldade de cálculo cresce com o QUADRADO do número total de ÁTOMOS; baseando-se em mecânica quântica, a complexidade cresce com a QUARTA POTÊNCIA do número total de ELÉTRONS). Dessa forma, tipicamente emprega-se física clássica nessas simulações (exceção destacada bem adiante, apenas no caso do core QMD do F@H). Essas metodologias geram uma interface entre resultados obtidos em experimentos de laboratório com as teorias da Física, Química e Físico-Química que possui muitas aplicações no meio científico, basicamente por proporcionar uma visão microcópica dos fenômenos que somente pode ser inferida indiretamente no experimento. O projeto Folding@home utiliza-se de simulações de dinâmica molecular sob diferentes metodologias para estudar o folding de uma proteína."

Valeu, vou modificar !

3 - Na parte onde tu fala do tempo pra calcular um nanossegundo do sistema, ressalta que a dependência desse tipo de cálculo é basicamente com o número de átomos envolvidos. Basicamente, com o quadrado do número de átomos envolvidos.

Eu preferi não adentrar muito nisso porque também depende da solvatação, se "tá na caixa" ou "na membrana".. mas vou falar isso sim, obrigado !

4 - na parte do porque não usar um super-computador, entre também no fato (uma linha) de q tem muito poder computacional ocioso diariamente no mundo, e que é muito mais rápido nós irmos atualizando as nossas máquinas ociosas pelo mundo do que eles acharem outra empresa caridosa afim de doar outros bilhões de dólares pra algo tão fútil como curar doenças... Afinal, se ainda fosse pra descobrir novas formas de MATAR pessoas, mas não os inocentes querem ir lá e SALVAR, dá nisso...

Fato muito bem lembrado !

Só isso, e novamente, tá de parabéns pela iniciativa!

P.S.: Xita, tu viu que acabaram de lançar o Duke Nuken Forever, errr, Gromacs 4 (RC1, nothing is perfect!)? Cara, vou me dar ao luxo de ser um pouco off e postar anexo aqui pra eternidade o email de anúncio:

Desculpa, mas não deu pra deixar passar essa!

kkkkkkkkkkkkkkkkkkkk vi nada, mas valeu por informar !

Preciso entrar na Newsletter deles.

Obrigadaço pela ajuda Johannersrs !

Aêêee!

Demorou hein?!

Parabéns XITA, assim que estiver com meu PC de volta, vou dar a minha humilde contribuição com meu micro se possível em 24/7. De todo jeito ele fica assim quase que direto, pelo menos vai ter mais uma utilidade além de downloads.

abraços.

Opa, valeu !

Eu entrei nessa também por isso.

Johannersrs, mudei algumas coisas com suas sugestões, muito obrigado !

Oi pessoal,

Agradeço a participação de todos neste projeto e em nosso time.

Por favor, não se esqueçam de usar o nosso time (148894), senão os resultados não serão contabilizados para o nosso time.

Sugiro que todos usem o mesmo nome que usam aqui no fórum para facilitar a identificação. Sugiro ainda que criem o tal do passkey (senha) para que ninguém "roube" o seu nome de usuário por lá.

Pretendemos integrar o fórum ao nosso time do Folding @ Home, mostrando o seu ranking em nosso time juntamente a outras estatísticas.

Não descartamos a possibilidade de fazermos premiações baseadas no ranking no Folding @ Home no futuro.

Eu mesmo estou participando, já instalei o bicho em duas máquinas, na minha pessoal e em um servidor Linux que tenho aqui no escritório para simular o fórum localmente.

Abraços,

Gabriel Torres.

Só um lembrete, usuários com placas de vídeo DirectX 10 (i.e. Radeon HD 2000 para cima ou GeForce 8 para cima) devem baixar e instalar a versão "GPU" do programa, para que ele use o chip gráfico da placa de vídeo para executar cálculos (técnica chamada GPGPU). Usuários do Linux com processadores dual-core ou quad-core devem estar rodando Linux de 64 bits para que o programa reconheça mais de um núcleo.

Oi Heberton,

Já vi que você está na minha cola... hi hi hi :D

Para acompanhar o desempenho do time, este site aqui é melhor organizado que o site da universidade:

http://kakaostats.com/t.php?t=148894

Abraços,

Gabriel.

Aeee muito bom :D. Já participo do F@A a algum tempo, mas para outros times , muito bom que agora posso ajudar o CdH.

Xita o tutorial ficou impecavel, parabéns. Eu só queria saber uma coisinha: Posso usar um cliente CPU e um GPU ao mesmo tempo??? Me da uma pena ver minha VGA ligada durante a semana sem fazer nada só esperando pra entrar em ação nos fins de semana .

Bom parabéns novamente e Let´s fold the world!!!!!!

P.S: O Alonso com esse monstro vai espantar até os criadores do projeto, hehehehehehe.

Boa, XITA! Gostei da iniciativa e já estou baixando o client!

Mas só tenho uma dúvida: uma banda estreita atrapalharia? Pois a minha conexão não é lá essas coisas (Claro EDGE que roda a uns 100Kbps... 3G, chega logo!).

Valeu pelo apoio

Sem problemas, os arquivos são pequenos e não é todo dia que ele está enviando/recebendo os pacotes. Quando ele usa a internet são arquivos pequenos, e quanto mais longa é a corrida maior é o arquivo, então isso fica meio balanceado

Aeee muito bom :D. Já participo do F@A a algum tempo, mas para outros times , muito bom que agora posso ajudar o CdH.

Xita o tutorial ficou impecavel, parabéns. Eu só queria saber uma coisinha: Posso usar um cliente CPU e um GPU ao mesmo tempo??? Me da uma pena ver minha VGA ligada durante a semana sem fazer nada só esperando pra entrar em ação nos fins de semana .

Bom parabéns novamente e Let´s fold the world!!!!!!

P.S: O Alonso com esse monstro vai espantar até os criadores do projeto, hehehehehehe.

Valeu pela participação Pedro !

E que bom que gostou do tutorial.

Bem, pelo que eu li no forum deles dá pra rodar os dois ao mesmo tempo, como eu não tenho nenhuma VGA DX10 próxima pra eu usar de cobaia não posso te informar.. se você quiser colaborar eu ficarei muito grato

Mas cuidado com a conta de luz, CPU e VGA 100% o dia todo vai gastar um tanto razoável de energia ehheheheeh

Bom vou ser essa cobaia então . Vou usar esse mes o Tray de GPU, se a conta subir muito eu desinstalo.

Abraço

Valeu! O cliente já está rodando aqui. Só tive um pequeno problema quando abri o Display. Ele exibiu a animação sem problemas, só que fui fechar e ele travou. Tive que fechar o cliente e abrir de novo... Acho que não é normal, é? De qualquer jeito não está atrapalhando o serviço.

Já vi isso acontecer também, não sei o porque, mas parece que às vezes acontece.

Uma coisa que reparei é que as FX aparentemente não exibem o display.

Bom vou ser essa cobaia então . Vou usar esse mes o Tray de GPU, se a conta subir muito eu desinstalo.

Abraço

Huahuahuahaha só usar com moderação heheeheh

Não precisa desinstalar, só não rodar