Nem sei se você já resolveu o problema. Mas aqui vai a solução para quem se encontra na mesma.
Vi em alguns fóruns que isso é causado pela diferença de frequência de ambos monitores, não sei a solução certa para placas nvidia, mas creio que deve ser o mesmo caminho.
Vá no software da AMD, em seguida vá em tela. Veja a taxa de atualização do seu monitor principal em (kHz) e (Hz). Em seguida vá para o monitor secundário e crie uma resolução personalizada colocando a mesma taxa de atualização em (khz) e (hz) do monitor principal, vá na área de trabalho, configuração de exibição, configurações avançadas da tela, exibir propriedades do adaptador de vídeo do monitor (1 ou 2) no caso o que você acabou de alterar a configuração, monitor, e mude a taxa de atualização para 60hz, aplique a resolução do software da AMD que você configurou e pronto.
Meus dois monitores são AOC um 1980x1080 60hz o outro 1378x768.
OBS: Meu monitor secundário estava em 59hz e a taxa de khz não era tão distante, acredito que se fizer com monitores 75 pra cima, vai dar *****.