Oi Ruan. Eu também fiz alguns experimentos utilizando as pastilhas peltier recentemente.
No caso do superaquecimento dos fios da fonte eu recomendaria verificar a possibilidade de unir vários polos iguais de mesmo potencial (12V) eu fiz isso e funcionou bem. Quanto ao aquecimento do fio da pastilha, eu creio que deva ser normal, desde que não seja excessivo, pois eles vêm dimensionados para a corrente gerada pelo equipamento trabalhando na tensão correta (12V). Não há como evitar o aquecimento deste fios, pois eles acabam ficando muito próximos do dissipador de calor da pastilha peltier.
Quanto à potencia da tua fonte, uma pastilha peltier padrão gera uma potência de 100w e eventuais quedas de tensão em razão da qualidade da fonte não são um problema para equipamentos "resistivos", entretanto estas quedas podem ser um problema para o teu computador. Sugiro comprar uma fonte separada para o experimento peltier.
O grande negócio dessas placas é conseguir dissipar o calor gerado por elas, por isso o mecanismo de dissipação deve ser muito dimensionado.
adicionado 15 minutos depois
E ai Johnny!
Cara eu também investi nesse "sonho"!
O engraçado é que, apesar dos percalços e de saber que é um sistema ineficiente, eu ainda não desisti de tentar.
Conforme eu testemunhei acima, eu consegui obter uma boa troca de calor, mas utilizando um dissipador gigante e dois ventiladores de gabinete dos grandes. Ficou horrível a gambiarra, mas refrigerada consideravelmente as pastilhas.
No caso do teu sistema, tu acredita que tenha conseguido uma boa dissipação do calor?