Os modelos horizontais são para ser seguidos a seu padrão e o mesmo vale para os verticais, ou seja," Vertical - Em Pé ou Horizontal - Deitado".
Riscos sempre existem, o HD é um deles. Vejamos assim; simplesmente virar um componente para baixo ou para lateral, uma vez que foi fabricado para ficar na horizontal é um tanto arriscado o principal problema é perda de desempenho ou até mesmo a perda do componente. (Não se deixe levar pelo estilo "Não é assim, mas da certo). Isso pode custar caro em dias, meses ou anos.... O certo é não arriscar, meus amigos!
O mais viável a se fazer seria trocar o gabinete por um original horizontal ou fazer um case total para re-adaptar a placa-mãe para a horizontal preservando às saídas e entradas de ar e o espaço dos demais hardwares.
O mais certo seria deixá-lo como está e trabalhar um espaço para ele na vertical mesmo.
E nunca coloque nada em cima do gabinete (mesmo monitores LCD do mais leve que seja).
Cada componente tem um peso e local dentro do gabinete, mudanças não estudadas podem sim danificar seu PC com o tempo.
PS. RTX