Bom, o kit inclui cpu e placa-mãe, então não tem muita questão de compatibilidade, se for trocar esses dois componentes.
RAM DDR4, funciona.
Placa de vídeo, funciona.
Agora, se você pretende usar a CPU na sua placa atual (ou a placa nova com sua cpu atual), não vai dar certo. Soquetes diferentes.
Fora isso, é só você avaliar se essa troca realmente vale a pena pra você.
EDIT: Esqueci de falar sobre o consumo de energia.
O processador do kit (Xeon E52650 v3) tem uma diferença bastante notável no consumo de energia pro seu processador atual. Coisa que é justificável pelas especificações dele. (65W para 105W)
https://www.intel.com/content/www/us/en/products/sku/81705/intel-xeon-processor-e52650-v3-25m-cache-2-30-GHz/specifications.html
https://ark.intel.com/content/www/us/en/ark/products/190886/intel-core-i39100f-processor-6m-cache-up-to-4-20-GHz.html
https://www.amd.com/en/products/graphics/Radeon-rx-550