Boas,
Pode ter a possibilidade de ser algum problema da entrada SATA, tente conectar o HD em outra entrada e veja se persiste.
Caso seja o SSD a não ser detetado:
Pode ser defeito do SSD, ou alguma má configuração na motherboard em relação ao controlador SATA (configuração entre Legacy e AHCI, por exemplo. Só vai saber se alterar na BIOS/UEFI e testar, não há volta).
Caso seja o HD a não ser detetado:
A motherboard pode ter "adaptado-se" ao sistema SSD, e "desconfigurar" a maneira de como o SATA do HD trabalha, pode tentar colocar o modo SATA na BIOS/UEFI entre Legacy e AHCI.
Pode ser também alguma má conexão que haja, por exemplo, no cabo SATA ou no próprio cabo de alimentação SATA da fonte, ou até mesmo no módulo da fonte.
Eu tentaria verificar, se possível, em outro computador, se o componente com defeito era deteado, só para ter certeza.