Estava com o mesmo problema após ter formatado meu pc recentemente (já tinha tido uma vez e não lembrava como tinha resolvido). Bom, vou mostrar a maneira que eu resolvi dessa última vez porque não vi ela em nenhum outro lugar ainda:
- Clique com o botão direito no Meu Computador / Gerenciar
- Vá em Gerenciador de Dispositivos
- Controladores USB
- Selecione um por um, vá em Propriedades, depois na aba Gerenciamento de Energia e desmarque a opção "O computador pode desligar este dispositivo para economizar energia".
Depois disso, não tive mais problemas e pude configurar o tempo de desligamento do monitor, suspensão e hibernação que o pc voltava a funcionar tranquilo.
Isso é devido a os dispositivos que acordam o computador utilizarem as portas USB pra fazer a comunicação. Sendo assim, o mouse ou teclado estavam aptos a acordar o computador mas não tinham energia ou não eram reconhecidos porque o computador desligava a porta USB que eles estavam ligados.
Ainda no Gerenciador é bom dar uma conferida no mouse e teclado ver se a opção "Permitir que este dispositivo acorde o computador" está ativa, pois se não estiver pode ser esse o problema também.