Ao executar a instalação do Windows 10, na opção de selecionar o local destinado a mesma, escolha "selecione" o SSD. A instalação será efetuada sem nenhuma relação com o disco(HD) de 1TB
Quanto aos arquivos do disco(HD) deve-se observar que:
Sistema operacional/aplicativos que estejam instalados no mesmo não terá utilidade. Mas se quiser pode por exemplo ter o Windows no SSD e um Linux no disco(HD)
Arquivos pessoais (documentos, fotos/vídeo, música, etc...) que estejam no disco(HD) você pode jogar para um disco(HD) externo ou pra nuvem (google Drive, Mega, OneDrive, etc....)
Eu tenho Um SSD de 240GB onde está o Windows 10/Aplicativos, um SSD de 120GB onde está o Linux OpenSuse, um disco(HD) de 1TB e um disco(HD) externo de 500GB
* meu disco(HD) externo está vinculado ao google Drive (backup de documentos/processos de trabalho)
* As pastas Documentos/Downloads/Música/Vídeo/Imagens do Windows (SSD) está vinculada ao disco(HD) de 1TB. Ou seja, todo download que eu faço., por exemplo de um aplicativo, de um filme, de músicas., e/ou qualquer documento que seja salvo no Libreoffice, ou qualquer item que seja transferido de uma mídia externa (um smartphone por exemplo), vai direto para o disco(HD)
* O ideal é antes de instalar o Windows no seu disco(SSD) fazer cópias/backups do que julga importante e que estão no disco(HD) e depois formatar o mesmo., usando-o depois para armazenar seus arquivos.
Para vincular as pastas padrões do Windows a outro disco, após a instalação vá em cada pasta (botão direito do mouse) -> propriedades(aba local)-> opção mover. indique o novo local., no caso o disco(HD).