Olá
Obrigado por organizar e expor claramente tua dúvida. Isso ajuda muito!
1- O tamanho de alocação é a menor porção lógica de espaço em disco que pode ser alocada para armazenar um arquivo. Um tamanho de alocação maior trará maior velocidade de leitura por ter um número menor de clusters. O tamanho de alocação menor é valido para quando se tem uma grande quantidade de arquivos pequenos, assim evitando o desperdício de espaço causado por clusters grandes. A imagem abaixo ilustra o desperdício e a disparidade causado por isso. A Microsoft recomenda o uso do tamanho de 4096 bytes para um usuário padrão.
2- Essa opção fará a escolha dos itens conforme o padrão de fábrica. Ao invés de usar essa opção, selecione manualmente o sistema de arquivos NTFS (por ser mais seguro) e o tamanho de alocação de 4096 bytes (por ser o padrão recomendado e por ser um meio termo entre desempenho e desperdício)
3- Sim, esse é o nome dado à unidade, coloque o nome que desejar.
4- A formatação rápida é mais utilizado em momentos de pressa com, por exemplo, pendrives. Em um HD é recomendável que se faça uma formação completa (desmarcando essa caixa). Isso fará que seja formatado e seja feita uma busca por setores defeituosos, garantindo estabilidade á unidade.
5- O sistema é capaz de ler e utilizar qualquer arquivo, estando ele na unidade C ou F. Você pode instalar tranquilamente seus jogos e arquivos na unidade F, porém o desempenho não será igual como se fosse instalado no SSD, pois o mecanismo que fará a leitura será o do HD (que é mais lento). O uso do HD ou SSD influenciará na velocidade de carregamento e leitura de jogos e programas, mas não em FPS (desempenho gráfico). Instale os jogos e programas novamente no HD e não apenas copie eles já instalados de outra unidade, pois isso poderá ocasionar erros em programas e jogos.
Tentei deixar a resposta o mais simples e completa possível. Qualquer dúvida poste novamente!
Atenciosamente,
Ufrarion