O tópico é um pouco antigo mas vamos la.
Estava com exatamente o mesmo sintoma, e no meu caso a temperatura fazia cair o clock da placa, eu encontrei o problema, pode ser a mesma coisa em outros casos.
Comprei uma XFX 7850 1GB usada, o modelo com um unico cooler, pequeno pra falar a verdade. Enfim, notei alguns problemas logo de inicio,
1 - O clock da gpu caia de 860 Mhz para 450Mhz do nada e os jogos ficavam com aproximadamente metade dos fps, isso eu notava imediatamente no meio do game. Achei que pudesse ser software, mexi no MSI AB, nos programas da amd, e nada.
2 - Eu ligava o computador e fazia um benchmark ou jogava, o clock era o ótimo 860 Mhz, depois de um tempo caia de novo, a temperatura estava alta,chegava nuns 95º
3 - Eu liguei o PC com o gabinete aberto e notei que o fan da VGA não ligava de inicio, mas depois que atingia certa temperatura ligava, achei que isso era um processo normal da placa pra não gerar barulho quando não precisa.
4 - Notei no MSI AB que dizia que a velocidade do cooler era 99% e não dava muito barulho, o que é estranho, devia fazer mais barulho.
5 - Onde descobri o problema por acaso. Como a temperatura estava alta, ela devia diminuir o clock para evitar queimar por super aquecimento. Resolvi retirar o dissipador da placa, limpar, tirar poeira etc, na hora que eu pego o fan que tirei para limpar, dou um leve empurrão nele e percebo que ele estava duro, difícil de rolar, isso explica tudo. O problema era no fan, que aumentava a temp que diminuia o clock.
Por isso no MSI AB dizia uma velocidade de fan, mas como ele estava duro, ele rodava bem mais lento, ou nem rodava quando não tinha energia suficiente. Infelizmente o fan não dá pra abrir pra tentar lubrificar etc, tentei forçar e acabei quebrando ele, nesse exato momento estou testando, com um fan de 120mm ligado na fonte, e esta tudo ok, a temp chegou a uns 83º, o clock não caiu, e parece que era esse o meu problema, tenta da uma olhada no estado do ventilador/fan da propria VGA e veja se ele rola suave. Aproveita para limpar a poeira se precisar... Espero que isso ajude. As fotos são de agora, tirei o fan da placa e está com um fan de gabinete em cima do dissipador, agora preciso conseguir outro fan desse tamanho e acho que o problema está resolvido.