Olá, amigo!
Primeiramente antes de iniciar o computador pelo CD ou outro dispositivo como pendrive, você precisa configurar as opções de boot do Setup, seleccionando como primário o dispositivo que deseja. A maioria das placas usa a tecla Del ou Delete para entra no Setup, mas também pode ser F1, F2 ou F10 o que vária de um fabricante para o outro. Você pode descobrir qual tecla ligando o computador e a primeira tela que se apresenta mostra essa informação no rodapé, caso passe muito rápido, reinicie e quando entra na tela novamente aperte "PauseBreak" que o pc trava a inicialização. Quando acessar o Setup faça a configuração e salve com F10. As vezes no rodapé também aparece opção de tecla para escolher em seguida por onde deseja fazer o boot sem necessidade de entra no Setup para configurar, geralmente é a tecla F8 para as placas mais antigas, mas a maioria hoje em dia usa a tecla F12.
Obs; se o seu HD já tem um sistema instalado você pode usar sem precisar formatar, porém será necessário na primeira vez que inicializar com a nova placa mãe, logar em modo de segurança, entrar em Painel de Controle, Sistema ir em Gerenciador de Dispositivo e excluir os drivers da placa mãe antiga. Feito isso pode iniciar normal.