Cara.. creio que você teve um azar muito grande... mas vamos lá...
1. Se ela não faz SLI 16x, você deveria ter visto antes de comprar.. aon invés de reclamar;
2. O mesmo vale para o PCI-E 1.0.... já que ela saiu ANTES do 2.0!!!;
3. Não sei como você fica impossibilitado de usar USB frontal... é fisicamente impossível isso... a não ser que sua vga encoste no "chao" do gabinete... o que com certeza não acontece... o plugue do USB frontal fica no limite da placa... e o segundo slot pci-e fica 3 slots acima da linha da conexão USB...
5. era só você ter comprado um cabo SATA daqueles em "L"... onde a ponta menor do L seria a que conectria na placa.. logo, você não teria problemas com isso!!
Essa placa foi considerada a melhor para SLI na relação custo x benefício, pois é relativamente barata, eficaz, e ótima para overclock!!!
Se quisesse algo melhor, de nível superior, era só ter desembolsado mais...
Repito, o que você teve foi muito azar do SLI não estar legal.
Antes de algo mais, experimente fazer SLI com outro par de vga e veja como fica... de repente, as vga's que nao estão bem no SLI, ou a ponte SLI n tá boa... ou realmente sua mobo n tá lega!!!