A asus prime é problemática por não ter dissipador no VRM, precisando de um fluxo de ar aumentado para compensar (o que não é tão difícil de se fazer). A MB que mais indico hoje é a Gigabyte B450M DS3H. Como os estoques estão reduzidos e o dólar está alto, estamos comprando ela hoje com preços bem elevados.
Sobre suporte, todas as placas AM4 vendidas hoje já vem com suporte à terceira geração Ryzen. O 1600 AF, apesar de teoricamente ser da primeira geração, precisa de placas mães com suporte à segunda para funcionar corretamente (por dentro ele é segunda geração).
Não recomendo que compre componentes aos poucos, pois assim você desperdiça sua garantia e acaba comprando componentes agora que daqui há 3 meses terão versões melhores e mais baratas no mercado. Melhor usar uma boa e velha poupança e comprar tudo de uma vez.
Na verdade você não precisa investir mais na placa-mãe. Hoje é importante investir bem em todos os componentes, sempre primando por boa qualidade em tudo, para ter um sistema equilibrado e durável.
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Lista de gabinetes que recomendo por terem melhor fluxo de ar:
Aerocool Aero 500G RGB BK
Aerocool Aero One Frost
Corsair Carbide Series SPEC-DELTA
Cougar MX330-G
Deepcool E-Shield
Deepcool Matrexx 55 Mesh
Thermaltake Comander C35 TG ARGB
Thermaltake Versa J24
Fontes de qualidade: Corsair VS 450 (a mais simples), CX 550 ou XFX XTR2 550
Boas marcas de memórias: G.Skill, Geil. Patriot, Corsair, Crucial, Adata/XPG
SSD (dê preferência para interface M.2): G.Skill, Geil. Patriot, Corsair, Crucial, Adata/XPG, Intel, Samsung
Ventoinhas: Thermaltake, Aerocool, Deepcool, Cooler Master, Noctua
Coolers: Cooler Master H411R, Hyper 212 (normal ou turbo), MA410P, MA620P
GPUs e MBs: MSI, Gigabyte, Asus e Galax.