Cara, alguns modelos FAT (em maioria 20 e 60GB e edições especiais antigas) são retrocompatíveis com games de PS2, possuem diversos slots para cartões e 4 entradas USB, mas esses modelos são conhecidos por aquecer em demasia e causar YLOD (apesar do risco ser pequeno).
Todos os FAT (20, 40, 60, 80 e 160GB) tem a possibilidade de instalar outro sistema operacional como o Linux e retrocompatibilidade com PS1.
Mas, o Slim tem vantagens como menor consumo de energia e drive de Blu-Ray ligeiramente mais rápido (pelo que notei). A instalação do Devil May Cry 4 demorou 26 minutos em meu PS3 40GB e 21 em um PS3 Slim 120GB de um amigo meu.
É importante lembrar que não é possível executar Backups de jogos de PS1 e PS2 em um PS3. E a trava de região para esses jogos é igual aos videogames anteriores. Por exemplo:
Meu PS3 é Chinês. Tem região A (1) para Blu-Ray, região 3 para DVD e executa jogos de PS1 de região NTSC-J.
Os jogos de PS3 são Region-Free e a maioria dos filmes em Blu-Ray também... No meu caso, perco o Playback de DVDs originais e execução de jogos de PS1 (Apesar de só ter Metal Gear Solid NTSC-U).
Então aconselho que compre um Slim e seja feliz.