Tem o Reset Permission Free http://lallouslab.net/2013/08/26/resetting-ntfs-files-permission-in-windows-graphical-utility/
Vale apontar que o programa usa o mesmo sistema que o Windows utiliza para alterar a permissão, nenhuma ferramenta de terceiros é usada, para mais detalhes você pode acessar o site da Technet. Vale salientar que é necessário estar conectado com uma conta de administrador, caso não esteja, conecte-se.
Atenção: É recomendado antes de fazer qualquer alteração que você crie um ponto de restauração. Para isso abra a pesquisa do Windows (Window+S), e digite restauração.
O funcionamento do Reset Permission é relativamente simples, clique em Choose Folder para definir a pasta, restaure as permissões com a opção Reset Files Permission e tome propriedade delas com a opção Take Files Ownership. Caso queira fazer para todos os subdiretórios, marque a opção Apply for All sub directories. Feito isto, é só apertar em GO.
Uma janela avisará quando o procedimento estiver finalizado. Recomendamos que se for fazer mais de uma alteração, primeiro restaure as permissões para depois alterar permissão delas.