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Um tempo atrás eu estava precisando exportar os registros de .dBASE para o MySQL, mas como não é possível importar dessa forma, eu tive que usar muitos métodos, que foram: exportar o banco original para .txt, importar o .txt para o Access e a partir de lá utilizar um software chamado Bullzip MS Access to MySQL, que gerava o código SQL para a importação ao MySQL.

 

Ou seja, o que você pode fazer é gerar o código e executá-lo no MySQL. Como não tenho experiência alguma com o SQLite, dei uma pequena buscada no Google e encontrei um artigo que pode te ajudar: Artigo.

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