Para o 555 a forma de onda é essa mesmo, não tem milagre.
O temporizador desliga a saída antes do próximo pulso do clock, se quiser pode diminuir um pouco o valor do resistor.
Na imagem a carga do capacitor, é mostrada no gráfico laranja.
Consegui um "espaço maior no zero", simulando com um resistor de 2.7Kohm.
Se for montar na prática pode colocar até menos, no caso do Multisim 2.2Kohm deu erro (não entendi porque).
No seu caso eu utilizaria um contador CMOS ou um Flip Flop, tem vários por aí como 4013, 4029, 4017, 4022, 4029, 4518, 4520 e por aí vai. Com todos eles é possível fazer um divisor de frequência muito mais prático e preciso. Como esse:
E aproveitando o tópico...
Certa vez precisei criar um circuito ao contrário desse aí, um "Multiplicador de Frequência". Pois eu precisava obter 2Hz precisos a partir de um maquinário de relógio (desses de parede), onde o ponteiro "anda" na frequência de 1 Hz.
Adaptando esse circuito aí, consegui fazer o tal "Multiplicador":
Com um formato de onda meio estranho, mas suficiente para excitar o Clock dos contadores CMOS: